Manuel Pinto da Costa (Agua Grande, 5 août 1937) est un économiste et homme politique de Sao Tomé.

Il a occupé le poste de président de Sao Tomé-et-Principe entre 1975 et 1991, où il a dirigé le pays et joué un rôle important dans la lutte pour l'indépendance du Portugal.

Éduqué à la Humboldt-Universität Berlin en République démocratique allemande, l'ancienne Allemagne de l'Est, il parle couramment le portugais et l'allemand.

Il a également participé au Mouvement de libération de São Tomé e Príncipe, le MLSTP, qui a acquis son indépendance avant le Portugal. Durant son règne (1975-1991), le premier après l'indépendance du pays, un système socialiste à parti unique a été institué.

Le 31 janvier 1986, il reçut le titre de Grande-Colar de l'ordre du prince Henri, navigateur du Portugal.

En 1996, il sollicita à nouveau le poste de président, perdant aux élections son concitoyen universitaire dans le cadre de la loi Miguel Trovoada, par une faible marge de voix. En 2001, il est de nouveau battu, cette fois par Fradique de Menezes, au premier tour des élections.